Rond 1919 begon een groep jongeren op ontgonnen heidegrond op De Bisselt te voetballen onder de naam De Treffers. Onder leiding van toenmalig voorzitter Jan Piepenbreier verhuisde de club naar Groesbeek. Ongeveer vanaf 1930 begon de aansluiting van De Treffers bij de top van de RKF (Roomsch-Katholieke Federatie).
In de opvolgende seizoenen 1935/36 en 1936/37 werd het kampioenschap van de eerste klasse in het district Oost behaald. In de strijd om het landskampioenschap met de andere districtskampioenen was De Treffers nog niet goed genoeg.
Na de Tweede Wereldoorlog volgde een mindere periode, maar na het seizoen 1961/62 wist het promotie van de derde naar de tweede klasse af te dwingen. Het hierop volgende seizoen wist De Treffers direct te promoveren naar de eerste klasse (tot 1974 het hoogste niveau in het amateurvoetbal), waar het met uitzondering van het seizoen 1971/72 in wist te blijven.
De Treffers speelde dan ook vanaf de oprichting van de Hoofdklasse in 1974 tot en met 2010 in de zondag Hoofdklasse, het hoogste niveau bij de amateurs. Geen enkele club wist dit ook te presteren. Acht keer werd De Treffers afdelingskampioen, drie keer werd het landskampioenschap bij de zondagamateurs behaald en twee keer werden De Treffers ook algeheel amateurkampioen van Nederland. Hiermee is De Treffers de meest succesvolle amateurclub in het zondagvoetbal. In 2009/10 promoveerde De Treffers naar de nieuw gevormde Topklasse.
De Treffers speelde op 20 augustus 2010 de allereerste wedstrijd in de Topklasse. Het was de uitwedstrijd tegen FC Oss. Namens De Treffers scoorde Koen Garritsen het eerste doelpunt aller tijden in de Topklasse Zondag. De wedstrijd eindigde in een 3-3 gelijkspel. De Treffers sloot het seizoen af op de vijfde plaats. In het seizoen erna wisten op de vierde plaats te eindigen en in het derde Topklasse-seizoen eindigde ze als derde. In dit seizoen werd ook de periodetitel gehaald, waardoor De Treffers volgend seizoen pas in de tweede ronde van de KNVB beker hoeft in te stromen, samen met de clubs uit het betaald voetbal. Aartsrivaal Achilles '29 werd in dit seizoen voor de tweede keer achtereen kampioen in de Topklasse en promoveerde naar de Jupiler League. Het seizoen 2013/14 zal hierdoor het eerste seizoen in de geschiedenis van beide clubs zijn dat Achilles '29 in een hogere competitie spelen dan De Treffers.
Op 18 mei 2013 werd voor het eerst in bijna 20 jaar weer de Districtsbeker Oost binnengehaald. De wedstrijd tegen mede-Topklasser HSC '21 werd op het eigen Sportpark Zuid met 2-0 gewonnen. De finale om de KNVB beker voor amateurs werd na verlenging verloren van SV Argon door een eigen doelpunt van Fabian Peppinck.
In 2016 werd de Tweede Divisie opnieuw ingevoerd. De Treffers wist zich hiervoor gelijk te plaatsen en heeft zich sindsdien steeds weten te handhaven. De vierde plaats in het eerste seizoen is tot op heden het beste resultaat.
De Treffers heeft vaak deelgenomen aan de KNVB Beker voor profclubs. Meestal bleef het avontuur beperkt tot een ronde, maar in 2003 schakelde De Treffers profclub FC Dordrecht uit door met thuis met 2-1 te winnen.
In de KNVB Beker van 2022/23 stuntte De Treffers door in de eerste ronde eredivisionist RKC Waalwijk uit te schakelen. In de tweede ronde werd vervolgens eredivisionist SC Cambuur uitgeschakeld. Dit maakte De Treffers de eerste amateurclub die in een bekerseizoen minimaal 2 clubs uit de eredivisie wist uit te schakelen. In de achtste finale werd De Treffers uitgeschakeld door eerstedivisionist De Graafschap.