Op 27 juni 1927 wordt 's avonds in een café te Maarssen, tot de oprichting van Maarssense Football Club (MFC) besloten. MFC gaat spelen in de Christelijke Voetbalbond. Dat betekende dat ze op zaterdag hun wedstrijden speelden. Door de geringe omvang van de toenmalige Christelijke Voetbalbond werd steeds weer tegen dezelfde tegenstanders, in kleine competities, gespeeld. Ook waren er een aantal leden die op zaterdagmiddag moesten werken. Op de ledenvergadering in 1932 werd besloten op zondag te gaan voetballen in de Utrechtsche Provinciale Voetbalbond (UPVB), onderbond van de KNVB. Een aantal leden bedankten om principiële redenen. Doordat in de KNVB reeds een club speelde onder de naam MFC moest er een nieuwe naam komen. Uit de keuzemogelijkheid van drie namen kwam VV Maarssen uit de bus.
In 1933 start VV Maarssen als zondagclub met een jeugdafdeling. Drie jaar voor de Tweede Wereldoorlog krijgt de club naast een zondagafdeling ook een zaterdagafdeling. De Maarssense zaterdagclub Blauw-Wit sluit zich dat jaar namelijk aan bij VV Maarssen.
In 1958 krijgt de vereniging op het terrein aan de Stationsweg de beschikking over een kantine. Voor f 400,- en met veel werk door eigen leden werd dit gerealiseerd. Vanaf 1970 spelen de lagere zaterdag- en zondagteams op sportpark Daalseweide. Op 25 mei 1975 vindt de definitieve overgang plaats naar het nieuwe sportpark.
In 1977 wordt begonnen met een zaalvoetbalafdeling. In 1978 wordt, ondanks enige problemen met de gemeente, de nieuwe tribune in gebruik genomen. Naast de regionale ontstaan er ook internationale contacten, zoals naar Duitsland, Engeland en Frankrijk. Verder neemt het schoolvoetbal een hoge vlucht naar 40 teams.
Het standaardelftal in het zondagvoetbal kwam laatstelijk in het seizoen 2018/19 uit in de Vijfde klasse van het KNVB-district West-I.
Begin jaren tachtig beleeft de club sportief gezien met dit team haar hoogtepunt. Het kwam vier seizoenen uit in de Tweede klasse, de hoogst bereikte klasse. In het tweede seizoen eindigde het op de tweede plaats in de competitie.
In het seizoen 2015/16 werd dit team, spelend in 5E, door de club teruggetrokken wegens een tekort aan spelers.[1]
In 1976 gaat de vrouwenvoetbalafdeling van start. In het seizoen 2013/14 speelde het eerste vrouwenteam voor het eerst in de landelijke Eerste klasse, van waaruit het in het derde seizoen (2015/16) promoveerde naar de Hoofdklasse. Het verblijf in deze klasse duurde een seizoen. In het seizoen erop in de Eerste klasse werd het klassekampioenschap in 1C behaald, zodat het vanaf het seizoen 2018/19 weer in de Hoofdklasse uitkomt.
