Zaïre-Emery begon op zijn vierde met voetballen bij Aubervilliers. In 2014 nam Paris Saint-Germain de middenvelder op in de jeugdopleiding. Aan het einde van het seizoen 2021/22 mocht hij zich van hoofdtrainer Mauricio Pochettino op vijftienjarige leeftijd laten zien bij het eerste elftal.[1] In de zomer van dat jaar tekende hij zijn eerste professionele contract, tot medio 2025.[2] Zijn officiële debuut beleefde Zaïre-Emery op 6 augustus 2022, in de Ligue 1 tegen Clermont Foot. Door goals van Neymar, Achraf Hakimi, Marquinhos en twee van Lionel Messi werd met 0–5 gewonnen in het Stade Gabriel Montpied. De middenvelder mocht van nieuwe coach Christophe Galtier acht minuten voor tijd invallen voor Marco Verratti. Hij was 16 jaar en 151 dagen oud ten tijde van zijn debuut en hiermee werd hij de jongste speler uit de clubgeschiedenis, een record dat tot dat moment op de naam stond van El Chadaille Bitshiabu.[3] Op 1 februari 2023 maakte hij zijn eerste doelpunt in het eerste elftal, op bezoek bij Montpellier. Na goals van Fabián Ruiz en Messi en een tegengoal van Arnaud Nordin besliste Zaïre-Emery in de blessuretijd de eindstand op 1–3. Hiermee werd hij de jongste doelpuntenmaker in de clubgeschiedenis.[4]