In 1991 werd Bakker artistiek leider van het [[Metropole Orkest]] en in [[1992]] chef-dirigent. Het Metropole Orkest groeide uit tot een van de's werelds toporkesten van wereld. Als chef-dirigent ontving hij de [[Gouden Harp]] van [[Conamus]] en met het orkest de "Ere [[Zilveren Reissmicrofoon]]" van de stichting Nipkow en de [[Gouden Notekraker]] van de [[Nederlandse Toonkunstenaarsbond]]. Bij het Metropole dirigeerde hij tal van radio- en televisieshows met nationale en internationale artiesten. Als chef-dirigent en artistiek leider van het Metropole Orkest trad Bakker op met onder anderen [[Andrea Bocelli]], [[Cristina Branco]], [[Patrick Bruel]], [[Chris de Burgh]], [[Joe Cocker]], [[Céline Dion|Celine Dion]], [[Herbie Hancock]], [[Shirley Horn]], [[Laura Pausini]], [[Cliff Richard]] en [[Toots Thielemans]]. Ook dirigeerde hij de muziek voor de met een [[Oscar (filmprijs)|Oscar]] bekroonde film Antonia's en voor Nederlandse films als [[De ontdekking van de hemel]], [[Kruimeltje (film)|Kruimeltje]] en [[Ja zuster, nee zuster]]. Door de [[Nederlandse Omroep Stichting|NOS]] werd Bakker gevraagd als vaste dirigent voor het Eurovisiesongfestival, tot in het jaar 2000 het gebruik van orkest voor dit evenement werd afgeschaft.
