Als gevolg van de [[Uitleg_van_Amsterdam_in_de_17de_eeuwUitleg van Amsterdam in de 17de eeuw#De_Eerste_en_Tweede_UitlegDe Eerste en Tweede Uitleg|eerste uitleg van Amsterdam]] was de oude Regulierspoort, waar de [[Munttoren (Amsterdam)|Munttoren]] nog een overblijfsel van is, vanaf 1586 binnen de omwalling komen te liggen. In 1587 werd dan ook een nieuwe Regulierspoort gebouwd op wat het Reguliersplein ging heten, tegenwoordig het Rembrandtplein.<ref name="Bakker2">Theo Bakker, pagina 2</ref>
In 1593 werd in het kader van de [[Uitleg_van_Amsterdam_in_de_17de_eeuwUitleg van Amsterdam in de 17de eeuw#De_Eerste_en_Tweede_UitlegDe Eerste en Tweede Uitleg|tweede uitleg]] begonnen met het aanplempen van [[Vlooienburg]], [[Uilenburg (Amsterdam)|Uilenburg]], [[Marken (Amsterdam)|Marken]] en [[Rapenburg (Amsterdam)|Rapenburg]].<ref name="Bakker2-3">Theo Bakker, pagina's 2 en 3</ref> De stadgrachtstadsgracht werd hiervoor iets naar het zuidoosten verlegd, waardoor de nieuwe Regulierspoort in een rare hoek ten opzichte van de omwalling kwam te liggen. In 1635 werd desondanks besloten de Tweede Regulierspoort, samen met de Tweede [[Heiligewegspoort]] en de [[Tweede Sint Antoniespoort]], opnieuw in steen op te trekken.<ref name="Bakker3">Theo Bakker, pagina 3</ref>
Hoewel snel werd aangevangen met de verbouwing van de Heiligewegspoort en de Sint Antoniespoort duurde het tot 1652 vooraleer [[Hendrick Ruse]] een ontwerp voor derde, stenen Regulierspoort presenteerde. Dit ontwerp werd tussen 1654 en 1655 gerealiseerd, ondanks het feit dat de plannen voor de [[Uitleg_van_Amsterdam_in_de_17de_eeuwUitleg van Amsterdam in de 17de eeuw#Vierde_Uitleg|vierdervierde uitleg]], die de poort binnen de stadsomwalling zou brengen, al vergevorderd waren. In 1663, amper acht jaar na de verbouwing, was de uitleg gereed en de poort overbodig geworden.<ref name="Bakker3" />
Om te voorkomen dat de verbouw helemaal zou neerkomen op kapitaalvernietiging, werd in 1668 besloten dat per 1 januari 1669 de [[botermarkt]] van de [[Dam (Amsterdam)|Dam]] naar de Regulierspoort zou verhuizen.<ref name="Bakker4">Theo Bakker, pagina 4</ref>
Gebrek aan onderhoud betekende dat er in 1854, 1862 en 1864 stemmen opgingen in de [[vroedschap]] om de waag te slopen. Uiteindelijk werd dit besluit in 1866 genomen en werd het gebouw in 1874 uiteindelijk gesloopt.<ref name="Bakker12">Theo Bakker, pagina 12</ref>
