Welke vogels er precies wel of niet tot deze orde behoren is een twistpunt in de [[taxonomie]] van de [[vogels]], omdat in de vroege [[SibleyDNA-Ahlquistonderzoek naar de taxonomie van de vogels|DNA-gebaseerde indeling]] de orde bijzonder sterk werd uitgebreid met groepen die er traditioneel niet in thuishoorden. Zij gebruiken de term "Ciconii" voor de Ciconiiformes zoals die hier gebruikt wordt.
[[Image:Watervogels2.jpg|thumb|left|400px|De 'watervogels' volgens Hackett et al (2008)]]
In het latere werk van Hackett dat op veel meer genetische gegevens gebaseerd is met veel betere technieken zowel in biochemisch als in statistische zin blijft van deze grootschalige uitbreiding weinigdeels overovereind, maar er zijn ook wijzigingen. De CatarthidaeCathartidae (gieren van de Nieuwe Wereld) blijken toch gewoon aan de gieren en arenden verwant bijvoorbeeld.Welen zijnde roofvogels behoren niet tot de Ooievaarachtigen. De flamingo's -altijd al een omstreden groep- zijn waarschijnlijk ook in het geheel niet verwant maar alle andere groepen zijn dat wel. Ze blijken echter wel verwant aan de pelikanen en een aantal van hun verwanten op een manier die de Ciconiiformes en de Pelicaniformes versmelt tot een nieuw geheel. Samen met een aantal andere water- en oceaanvogels vormen zij een vrij elegante supergroep ('watervogels') die genetisch met grote waarschijnlijkheid ondersteund wordt. Een opmerkelijke conclusie van het DNA-werk is echter dat de toerako's, een groep landvogels uit Afrika die altijd moeilijk te plaatsen was maar meestal in de Cuculiformes gezet werd een zustergroep van deze 'watervogels' zouden zijn.
