De prefecturale vlag van Niigata bestaat uit een rood vlak met een wit of goud prefecturale embleem in het midden. Het prefecturale embleem wordt gevormd door een gestileerde kanji 新 [nii] aan de bovenkant, en twee katakana-karakters: ガ [ga] aan de linkerkant, en タ [ta] aan de rechterkant, in de vorm van een kraag die harmonie, hoop en ontwikkeling van de prefectuur voorstelt. De prefecturale vlag werd op 23 augustus 1963 aangenomen.

Vexillologisch symbool voor een civiele vlag en dienstvlag te land? Vlag van Niigata (ratio 18:25)