In 1999 stemde de Utrechtse gemeenteraad in met sloop van het pand. Na een langdurige leegstand werd het echter begin [[2006]] [[kraken (pand)|gekraakt]]. De krakers woondenbewoonden het pand en er werd wekelijks een veganistisch eetcafé geherbergd gehouden en verder kunstexposities. Ook probeerden de krakers het pand voor de sloophamer te behoeden. De [[Vereniging Oud-Utrecht]], [[Erfgoedvereniging Heemschut]] en de Utrechtse Stichting voor het INdustrieel Erfgoed (USINE) bepleitten vervolgens de Vogelenburcht aan te laten wijzen als [[gemeentelijk monument]].<ref>Utrechtse Stichting voor het INdustrieel Erfgoed (2011), [http://www.usine-utrecht.nl/nieuws.aspx?ID=590 ''Vaaltterrein Weerdsingel Utrecht'']</ref> Tot die aanwijzing kwam het niet. Wel trok de gemeenteraad in 2012 de sloopplannen in met als doel het pand te kunnen behouden als te renoveren woonbestemming. In mei 2013 is het pand ontruimd ten behoeve van renovatie. Rond 2014 vond die plaats waarbij (onder meer) een contrasterende opbouw op het gebouw is geplaatst.
