De jeugdwerking van de club deed het daarentegen een stuk beter en de U-17 ploeg werd zelfs landskampioen. Het volgende seizoen werd de club achtste en voer ook op financieel vlak weer in rustig water. In [[2. Bundesliga 2007/08|2007/08]] speelde TSV een goede heenronde, maar zakte dan weg en kon pas op de voorlaatste speeldag het behoud verzekeren tegen [[VfL Osnabrück]], in de terugronde was de club zelfs laatste geworden. Seizoen [[2. Bundesliga 2009/10|2009/10]] begon slecht voor de club en een degradatie wenkte, maar door een goede terugronde werd de club nog achtste.
Financiële problemen staken weer de kop op en enkele dure spelers werden verkocht. In april 2011 kocht de Jordaanse zakenman Hasan Ismaik zich in de club in. Zijn bedrijf ''HAM International Limited'' kocht 60% procent van de aandelen. Omdat in het Duitse profvoetbal de ''50+1 Regel'' geldt (club mag niet voor meer dan 50% in buitenlandse handen vallen), kreeg Ismaik wel maar voor 49% procent stemrecht. In seizoen [[2. Bundesliga 2011/12|2011/12]] had de club voor het eerst sinds degradatie uit de Bundesliga een hoger gemiddeld aantal toeschouwers dan het jaar ervoor. De club werd zesde dat jaar en door de promotie van [[SpVgg Greuther Fürth]] werd TSV de club die al het langst onafgebroken in de huidige 2. Bundesliga speelt. In 2015 was degradatie nabij door een zestiende plaats en moest de club het behoud verzekeren via de eindronde. Voor 60.000 toeschouwers kon de club thuis [[Holstein Kiel]] verslaan en het behoud verzekeren. In het seizoen[[2. Bundesliga 2016/17|seizoen 2016/17]] degradeerde de club alsnog. Het kreeg echter geen licentie voor de 3. Bundesliga en was daardoor gedwongen om in de amateurs te gaan spelen. Reden was dat geldschieter Ismaik de benodige 10 miljoen voor de licentie niet op tafel kon leggen<ref>[http://www.ad.nl/buitenlands-voetbal/1860-munchen-noodgedwongen-terug-naar-de-amateurs~ad8190d8/ 1860 München noodgedwongen terug naar de amateurs], Algemeen Dagblad, 2 juni 2017</ref>.
