Jansen studeerde Arabisch en [[Semitische talen]] in Amsterdam, Leiden en Caïro. Na het behalen van zijn [[propedeuse]] [[theologie]] aan de [[Universiteit van Amsterdam]] en zijn [[doctoraalexamen]] [[Arabisch]] aan de [[Universiteit Leiden]] werkte hij in [[Egypte (land)|Egypte]]. Hij werd vervolgens universitair docent in [[Leiden]] en Groningen. Van 2003 tot 1 mei 2008 iswas hij [[bijzonder hoogleraar]] geweest voor het hedendaags [[Islamisme|islamitisch denken]] aan de [[Universiteit Utrecht]]. In de media trad Jansen vaak op in programma's waar de [[islam]] ter sprake komtkwam; hij was medewerker van het in 2008 ter ziele gegane opinieweekblad ''[[Opinio]]'' en van ''[[HP/De Tijd]]''. Ook werkte hij in Egypte als directeur van het Nederlands Instituut. Verder zat hij in de Nationale Adviesraad voor [[ontwikkelingssamenwerking]] en was actief voor het [[Rode Kruis]]. Hij publiceerde regelmatig in het dagblad ''[[Trouw (krant)|Trouw]]'' en op de website hoeiboei.nl<ref name="hoeiboei.blogspot.nl">http://hoeiboei.blogspot.nl/</ref> artikelen over de islam en zijn ervaringen als Nederlandse arabist. Ook had hij een wekelijkse column op [[GeenStijl]].
