In de normale Marvel-continuïteit (ook bekend als [[Marvel Universum#Marvel tijdlijnen|Earth 616]]) is Mary Jane Watson Peters vierde vriendin, na Liz Allan, Betty Brant en Gwen Stacy.
Mary Janes jonge leven was lange tijd onbekend. Het werd pas voor het eerst gedeeltelijk onthuld in ''Amazing Spider-Man''' #259 en geheel onthuld door [[Gerry Conway]]s verhaal ''The Amazing Spider-Man: Parallel Lives'' (Januarijanuari 1990). MJ kwam uit een probleemgezin. Haar vader, een professor en gefrustreerde schrijver, reageerde zijn woede af op zijn familie in de vorm van mishandeling. Mary Jane liet hier nooit iets van merken aan de buitenwereld. Haar ouders scheidden uiteindelijk, waarna Mary Jane en haar zus bij hun moeder verbleven. Mary Jane bezocht ook vaak haar tante Anna, die naast de Parkers woonde. In het begin was ze niet echt onder de indruk van Peter Parker. Dat veranderde drastisch op de nacht van [[Oom Ben]]s moord, toen MJ Peter Spider-Man zag worden voor de eerste keer. MJ hield deze kennis echter nog jaren voor zich, en vertelde zelfs Peter niet dat ze het wist (dit alles werd bekendgemaakt in het “Parallel Lives” verhaal.)
Mary Janes naam werd voor het eerst genoemd in ''Amazing Spider-Man'' (Vol. 1) #15 (Augustusaugustus 1964), maar ze was lange tijd een [[onzichtbaar personage]]. De eerste delen van ''Amazing Spider-Man'' bevatten het vaste patroon waarin Peter probeerde zijn [[Tante May]]s pogingen hem te koppelen aan “het nichtje van buurvrouw Watson”, die Peter nog nooit had gezien. Toen Peter haar dan toch te zien kreeg, werd hij op slag verliefd op haar. Peter begon met haar uit te gaan, tot woede van zijn oude vriendin Gwen Stacy. Toen de [[Green Goblin]] Gwen Stacy vermoordde, bleef MJ bij Peter tijdens de rouwperiode. Hierdoor ontwikkelde hun relatie zich nog verder. Echter, toen hij haar ten huwelijk vroeg weigerde ze, om dat ze zich niet wilde binden. Ze verliet New York een paar jaar.
MJ keerde uiteindelijk terug en haar gedrag veranderde sterk. Ze gaf toe dat ze al lang op de hoogte was van Peters geheime identiteit in ''Amazing Spider-Man'' (Vol. 1) #258. Uiteindelijk trouwden ze dan toch in ''Amazing Spider-Man (Vol. 1) Annual'' #21 (1987).
