Het bedrijf, opgericht in mei 2006, noemdeheette zichzelf in het beginaanvankelijk Catair. Deze naam kwamis voortafgeleid uit de streekvan [[Catalonië|Cataluña]] (Nederlands: Catalonië), de spaanse landstreek waar het bedrijf zich heeftis gevestigd. De naam Catair werd later omgedoopt tot het inmiddels bekende Clickair.
Luchtvaartmaatschappij [[Iberia Airlines|Iberia]] heeft 20% van de aandelen van Clickair in handen. Het bedrijf wilonderscheidt zich onderscheiden van de gevestigdeandere lowcost maatschappijen, zoals [[Ryanair]], door enkeluitsluitend op primaire luchthavens te vliegen.
