José Mari won in 2000 de zilveren medaille op de [[Voetbal op de Olympische Zomerspelen 2000/Voetbal|Olympische Spelen]] van Sydney. Spanje verloor in de finale na strafschoppen van [[Kameroens voetbalelftal|Kameroen]]. José Mari maakte op dit toernooi drie doelpunten: hij was trefzeker tegen [[Zuid-Koreaans voetbalelftal|Zuid-Korea]] en [[Marokkaans voetbalelftal|Marokko]] in de ghroepsfase en de [[Amerikaans voetbalelftal|Verenigde Staten]] in de halve finales. De aanvaller kreeg in de finale de rode kaart. José Mari speelde vier interlands voor het [[Spaans voetbalelftal|Spaans nationaal elftal]]. Hij debuteerde op 25 april 2001 tegen [[Japans voetbalelftal|Japan]]. Daarna speelde José Mari nog tegen [[Bulgaars voetbalelftal|Bulgarije]] op 20 november 2002, [[Duits voetbalelftal|Duitsland]] op 12 februari 2003 en [[Ecuadoraans voetbalelftal|Ecuador]] op 30 april 2003. Tegen Bulgarije maakte José Mari zijn enige interlanddoelpunt. Het was destijd de winnende treffer (1-0).
