Bèta-barrel: verschil tussen versies
Verwijderde inhoud Toegevoegde inhoud
Nieuwe pagina aangemaakt met '{{Dubbele afbeelding|right|Sucrose porin 1a0s.png|220|Rbp 1brp.png|160|18-strengse β-barrel. Dit is een porie-eiwit van de bacterie ''[...' |
k clean up en/of Typo fixing, replaced: {{citeer journal → {{citeer tijdschrift (4), | journal = → |tijdschrift= (4), | date = → |datum= (5), | title = → |titel= (5), |publisher= → |uitgever=, |location= met AWB |
||
Regel 1:
{{Dubbele afbeelding|right|Sucrose porin 1a0s.png|220|Rbp 1brp.png|160|18-strengse β-barrel. Dit is een [[Membraaneiwit|porie-eiwit]] van de bacterie ''[[Salmonella|S. typhimurium]]'' dat [[sucrose]] doorlaat ([[Protein Data Bank|PDB]]: {{PDB|1A0S}}).|8-strengs β-barrel. Retinol-bindind proteïne (RBD) met [[retinol]] (blauw) ([[Protein Data Bank|PDB]]: {{PDB|1RBP}}).}}
De '''bèta-barrel''' of het '''bèta-vat''' is een [[eiwitstructuur|vouwingsstructuur]] in [[proteïne|eiwitten]] bestaande uit herhalende [[bèta-sheet|bèta-platen]] die in een [[cilinder (meetkunde)|cilindrische]] conformatie zijn gedraaid. Beta-barrels zijn vernoemd naar hun gelijkenis met [[vat (verpakking)|vat]]en (Engels: ''barrels'') waarin men vloeistoffen bewaart. De meeste bèta-barrels zijn wateroplosbare eiwitten die een [[hydrofoob]] [[ligand (biochemie)|ligand]] kunnen binden. Ze komen ook voor in membranen en spelen dan een rol als selectief doorlatend [[membraaneiwit]]. Maar liefst 2–3% van de genen van gramnegatieve bacteriën coderen voor bèta-barrels in membranen.<ref name="Wimley">{{citeer
Over het algemeen bestaan de β-strengen van een bèta-barrel uit afwisselende [[polaire verbinding|polaire]] en [[apolaire verbinding|apolaire]] aminozuren. De apolaire aminozuren wijzen naar binnen en vormen een hydrofobe kern. De polaire aminozuren wijzen naar de buitenkant (naar het omliggende water). Bij membraaneiwitten die bèta-barrels bevatten, is dit patroon omgekeerd: de hydrofobe residuen wijzen dan naar buiten en zijn in contact met de omringende [[lipide dubbellaag|lipiden]].<ref>{{en}}{{sc|Zhang, X. C., & Han, L.}} (2016). How does a β-barrel integral membrane protein insert into the membrane?. ''Protein & cell'', '''7''' (7), 471–477. {{doi|10.1007/s13238-016-0273-6}}.</ref>
Bèta-barrels kunnen worden geclassificeerd in termen van twee parameters: het aantal β-strengen in de bèta-plaat ({{mvar|n}}) en de zogenaamde ''shear number'' ({{mvar|s}}), een maat voor de afschuiving van de eerste en de laatste streng.<ref>{{citeer
==Zie ook==
Regel 13:
{{Appendix||2=
==Bronnen==
* {{citeer boek|auteur=Branden, C. & Tooze J. |taal=en|
{{References}}
==Externe links==
| |||