Het wapen van Genderen werd op 16 juli 1817 bij besluit van de Hoge Raad van Adel aan de toenmalige Noord-Brabantse gemeente Eethen, Genderen en Heesbeen bevestigd. Op 8 mei 1819 wijzigde deze gemeente haar naam in Heesbeen, Eethen en Genderen. Op 1 augustus 1908 werd de gemeentenaam gewijzigd in Genderen. Op 1 mei 1923 ging de gemeente op in de nieuw opgerichte gemeente Eethen, waarmee het wapen kwam te vervallen. In het wapen van Eethen keerde het terug in de kwartieren I en IV. Tussen 1 januari 1973 en 1 januari 2019 viel Genderen onder de gemeente Aalburg, sindsdien onder Altena.
Het wapen is afgeleid van een schependomzegel. Het zegel uit ca. 1630 vertoont Sint Maarten, de parochieheilige van Eethen. Een later zegel toont uitsluitend een ongetoomd paard. Omdat bij de aanvraag geen kleuren waren gespecificeerd, is het wapen in rijkskleuren verleend.
