Uit onderzoek van het NRC bleek in februari 2020 dat het ILT rapport 'De borging van de nationale ruimtelijke belangen' onder druk van het ministerie van Binnenlandse Zaken en de leiding van de inspectie was achtergehouden - tegen de wil van medewerkers in - en dat een samenvatting van de conclusies was gemanipuleerd. Volgens de betrokken medewerkers zou het ministerie door het achterhouden van de het rapport de Tweede Kamer hebben misleid. De onderzoekers concludeerden onder andere dat lagere overheden vaak niet in staat zijn om toe te zien op een veilige opslag en transport van gevaarlijke stoffen. Deze conclusie zou mogelijk problemen opleveren voor de verregaande decentralisatie van het ruimtelijke ordeningsbeleid dat door de kabinetten Rutte I, II en III werd nagestreefd. <ref>[https://www.nrc.nl/nieuws/2020/02/09/zo-werd-er-toch-gebouwd-naast-een-vuurwerkopslag-a3989853 Zo werd er toch gebouwd naast een vuurwerkopslag] NRC, 9 februari 2020</ref> Hoewel de gestelde problemen worden onderschreven door inspecteurs van het ILT en hoogleraar gebiedsontwikkeling [[Co Verdaas]], gaf de top van het ILT en het Ministerie van Milieu en Wonen aan zich niet te herkennen in het door de NRC geschetste beeld <ref>[https://www.rijksoverheid.nl/documenten/kamerstukken/2020/02/10/kamerbrief-over-artikel-nrc-dd-9-februari-2020 Kamerbrief over artikel NRC d.d. 9 februari 2020] Kamerstuk: Kamerbrief | 10-02-2020</ref>
