In juni 2015 ontstond er een controverse rond Bot toen duidelijk werd dat hij bij het [[Openbaar Ministerie]] had gelobbyd voor Ismael A.Abudher, een zakenman uit de clan rond [[Moammar al-Qadhafi|Khadaffi]] die verdacht wordt van witwassen, fraude en het wegsluizen van 28,5 miljoen dollar uit Libische staatsfondsen. Het OM had beslag gelegd op bezittingen van Ismael AAbudher. In brieven aan de hoofdofficier van het [[Functioneel Parket]] had Bot aangedrongen op het opheffen van dat beslag en om ruimere informatie aan de verdachte over het onderzoek. Bot deed dat niet namens de lobbyfirma Meines Holla & partners waarvoor hij doorgaans werkt, maar 'als burger', in opdracht van Londense advocaten, via een eigen BV via welke hij zich liet betalen door de verdachte zakenman. NRC Handelsblad meent dat Bot daarmee in feite teerde op zijn reputatie als oud-minister en oud-diplomaat en dat daarmee de schijn van politieke beïnvloeding was gewekt. Zulks ten faveure van een controversiële familie die ook in de VS, Zwitserland en Noorwegen onderwerp is van strafrechtelijk onderzoek.<ref>Zie: [http://www.nrc.nl/nieuws/2015/06/06/ex-minister-ben-bot-lobbyde-bij-om-voor-verdachte-libier/ Ex-minister Ben Bot lobbyde bij OM voor verdachte Libiër], NRC Handelsblad, 6 juni 2015. Geraadpleegd op 15 juni 2015. Op deze webpagina kunnen ook diverse documenten rond deze zaak worden ingezien.</ref><ref>Zie: [http://www.nrc.nl/handelsblad/van/2015/juni/08/over-de-schreef-met-ben-bot-1502906 Over de schreef met Ben Bot], NRC Handelsblad, 8 juni 2015. Geraadpleegd op 15 juni 2015.</ref><ref>Zie: M/V van de Week, NRC Handelsblad, Opinie en Debat, blz. 3, zaterdag 13 en zondag 14 juni 2015.</ref><ref>[https://jdreport.com/oud-minister-ben-bot-wordt-miljonair-met-lobbywerk-voor-ghaddafi-clan/ Oud-minister Ben Bot wordt miljonair met lobbywerk voor Ghaddafi clan], JDreport.com, 9 juni 2015.</ref> Toen NRC Handelsblad via de [[Wet openbaarheid van bestuur]] de brieven van Bot aan het OM openbaar wilde maken, trachtte Bot dat via een kort geding te voorkomen, doch verloor.<ref>[https://www.nrc.nl/nieuws/2015/12/24/lobbybrieven-van-ben-bot-voor-client-uit-gaddafi-c-1570502-a601177 Lobbybrieven van Ben Bot voor cliënt uit Gaddafi-clan openbaar gemaakt], NRC Handelsblad, 24 december 2015.</ref>
