Op het grondgebied werden Gallische munten gevonden van de [[Morini (stam)|Morini]], [[Atrebati]] en [[Nerviërs]], evenals [[Romeinse]] munten, wat wijst op bewoning in die periode.
De oudste vermelding van het dorpje is van 1067 onder de naam ''Crochtem''. In 1183 wordt het nog een keer vermeld als ''Crothan''. De naamenaam komt etymologisch van het [[Oud-Nederlands|Oud-Nederlandse]] woord ''krochte''; wat een hoge en droge plaats betekent. Door de relatieve hoogte van de plaats ten opzichte van het omringende gebied. Het hoogste gedeelte van Krochte ligt nu op 32 meter. Krochte is hierdoor ook bijna nooit overstroomd geweest. De plaats ligt langs de vroegere Route du Collège, vroeger de Looweg geheten, een oude weg van [[Lo (Lo-Reninge)|Lo]] naar [[Loberge]], een weg die voortdurend de verhogingen in het landschap volgde langs de rand van de vroegere kustlijn. In Krochte staat de Sint-Joriskerk die gebouwd is in 1663 met de stenen van de oudere kerk.
