Girona FC werd opgericht op [[25 juli]] [[1930]]. In het seizoen 1936/1937 nam de club als ééneen van de vier Catalaanse clubs deel aan de [[Lliga Mediterrània]], een eenmalige voetbalcompetie tussen clubs uit de regio's Catalonië en [[Valencia (regio)|Comunitat Valenciana]] ter vervanging van de landelijke competities die ten gevolge van de [[Spaanse Burgeroorlog]] niet gespeeld kon worden. Girona FC eindigde op de derde plaats in deze competitie. In de loop der jaren speelde de club in totaal twaalf seizoenen in de [[Segunda División A]], de tweede Spaanse divisie, en twaalf seizoenen in de [[Segunda División B]]. De overige jaargangen werden doorgebracht in lagere divisies. In het seizoen 2004/2005 speelde Girona FC voor het laatst in de Segunda B. Met een zeventiende plaats in dat seizoen degradeerde de club naar de Tercera División. In het seizoen 2007/08 speelde de club weer in de Segunda B, waarna bovendien promotie werd bewerkstelligd naar de Segunda A in 2008. Girona FC promoveerde op zondag [[4 juni]] [[2017]] voor het eerst in de historie naar de [[Primera División]] door de tweede plaats achter kampioen [[Levante UD]]. Girona FC werd daarmee de 62ste club, die op het hoogste niveau van Spanje ging uitkomen. In het eerste seizoen in de [[Primera División]] eindigde de club op een knappe tiende plaats op de ranglijst. Zodoende komt de club ook in het seizoen 2018/19 uit in de [[Primera División]]. In 2019 won Girona FC de [[Supercopa de Catalunya]]. Door een benutte [[strafschop]] van [[Cristhian Stuani]] werd met 1-0 gewonnen van [[FC Barcelona]].
