Zijn [[rationalisme]] maakte het hem onmogelijk in het bestaan van een alles bestierend opperwezen te geloven, hoe zwaar hem dat ook viel.<ref>Kox, A.J. & P.H. Polak (1980) 'Door ervaring en rede', p. 32.</ref><ref>{{Citeer web|url=https://www.historischnieuwsblad.nl/nl/artikel/6920/de-geestelijke-worsteling-van-christiaan-huygens-1629-1695.html|titel=De geestelijke worsteling van Christiaan Huygens (1629-1695)|bezochtdatum=2017-11-03|werk=Historisch Nieuwsblad|taal=nl}}</ref> Christiaan Huygens overleed in Den Haag op 8 juli 1695. Kort voor zijn overlijden had hij van ellende nog een marmeren knikker ingeslikt, die hij met moeite weer uitspuwde.<ref>[http://www.dbnl.org/titels/titel.php?id=huyg007jour02 Journaal van Constantijn Huygens]</ref> Zijn wetenschappelijk archief liet hij na aan de [[Universiteit Leiden]], waar het nu nog in de [[Universiteitsbibliotheek Leiden|bibliotheek]] te vinden is. De familie Huygens behield instrumenten en lenzen. Deze collectie werd in 1754 bij opbod verkocht, zodat er veel verstrooid raakte. [[Rijksmuseum Boerhaave]] in [[Leiden]] bezit onder meer een aantal Huygens-lenzen en een [[planetarium]] dat volgens Huygens' ontwerp werd gemaakt.
