*Twee grote zijkapellen, één aan elke zijde van de kerk, zijn respectievelijk gewijd aan de H. Ignatius van Loyola en de Maagd Maria. De kleinere kapellen zijn eveneens rijk aan kunstschatten uit de tijd van Rubens en diens samenwerking met de Antwerpse jezuïeten: het monogram [[IHS]] aan het plafond, de schilderingen van onder andere [[Daniel Seghers]].
== Branden ==Br
*Op [[18 juli]] [[1718]] brak er brand uit in de kerk na een blikseminslag. Het interieur werd zwaar beschadigd en er gingen onder andere 39 plafondschilderingen van Rubens verloren. Na de brand kreeg de kerk een nieuw, soberder interieur, ontworpen door [[Jan Pieter van Baurscheit de Oude]].
*Op [[30 augustus]] [[2009]] werd de kerk wederom beschadigd door een brand. Rond 6.30u ging het rookalarm af, de brandweer was snel ter plaatse. Er werden twee brandhaarden gevonden, beide in de buurt van het altaar, één op de linkergalerij, één op de rechtergalerij. Het vuur was snel onder controle en de meeste kunstwerken werden niet rechtstreeks beschadigd door vlammen of bluswater.<ref>[http://www.demorgen.be/dm/nl/989/Binnenland/article/detail/984060/2009/08/30/Kortsluiting-veroorzaakt-brand-in-Carolus-Borromeuskerk.dhtml Lichtspots oorzaak van brand Carolus Borromeuskerk], [[De Morgen|www.demorgen.be]], geraadpleegd op 20 september 2009</ref>
