De eerste universiteitsgebouwen in De Uithof waren simpele houten onderkomens. De oudste nu nog bestaande gebouwen dateren van eindde jaren zestig: Transitorium 1 is in 1963 in gebruik genomen, Transitorium 2 in 1969. Sinds in het midden van de jaren tachtig een stedenbouwkundig plan voor het gebied is ontwikkeld door het [[Office for Metropolitan Architecture]] (OMA), is er een aantal spectaculaire nieuwe gebouwen neergezet. Voor deze gebouwen tekenden bekende [[architect]]en, of architecten die door hun prestatie hier bekend geworden zijn. Het gebied heeft hierdoor een bijzonder karakter gekregen. Een van de resultaten is te vinden in het gebouw van het departement natuur- en sterrenkunde van de faculteit bètawetenschappen: het Minnaertgebouw, waar zich in eerste instantie in de centrale hal een grote kunstmatige vijver bevond maar die nu vervangen is door bankjes en waar de kantine steunt op kolommen, die zodanig gevormd zijn dat ze de naam 'Minnaert' spellen. Het gebouw is ontworpen door [[Willem Jan Neutelings]]. Het Educatorium, het onderwijscentrum van de universiteit met enkele grote collegezalen en een [[Mensa (eetgelegenheid)|mensa]], is ontworpen door het OMA van [[Rem Koolhaas]]. [[Ben van Berkel]] ([[UNStudio (architectenbureau)|UNStudio]]) gaf vorm aan het Bloembergengebouw waarin onderzoek met behulp van NMR-technieken wordt verricht. In een van de gebouwen van de [[Hogeschool Utrecht]] is haar faculteit voor economie en management (FEM) gevestigd. Het is ontworpen door bureau [[Mecanoo]]. In september 2004 is de spectaculaire nieuwe universiteitsbibliotheek (architect [[Wiel Arets]]) geopend. Verder staat in de Uithof het Hijmans van den Bergh gebouw (2005), dat ontworpen is door [[Erick van Egeraat associated architects]] (EEA). De keuze voor prominente architecten is in belangrijke mate toe te schrijven aan voormalig bouwdirecteur [[Aryan Sikkema]].
In de begindagen van De Uithof werden alle universiteitsgebouwen eenvoudig ''Transitorium'', gevolgd door een nummer, genoemd. Transitorium (meestal afgekort tot ''Trans'') is Latijn voor doorgangshuis. In de loop van de jaren 90 zijn de meeste gebouwen genoemd naar beroemde Utrechtse wetenschappers, die actief waren in of rondom het vakgebied dat gehuisvest is in het naar hen vernoemde gebouw.
