SMILES: verschil tussen versies
Verwijderde inhoud Toegevoegde inhoud
Geen bewerkingssamenvatting |
|||
Regel 7:
Het molecuul wordt weergegeven in een [[boomstructuur]] en de SMILES voor dat molecuul wordt verkregen door de labels van de knopen in de [[Boom (datastructuur)|boom]] op te sommen zoals in een ''depth-first-search''.
Een label in de boom is de standaard representatie van het chemische element in rechte haken. De label van [[goud]] is dus <nowiki>'[Au]'</nowiki>. De rechte haken mogen worden weggelaten voor de "organische subset" te weten B, C, N, O, P, S, F, Cl, Br, en I. Alle andere elementen moeten tussen rechte haken genoteerd worden. Als rechte haken worden weggelaten wordt het juiste aantal impliciete waterstofatomen verondersteld. Zo kan water (H<sub>2</sub>0) in SMILES eenvoudigweg als 'O' worden geschreven. Evenzo kan [[methaan]] (CH<sub>4</sub>) aangeduid worden met '[C]([H])([H])([H])[H]' en het kortere 'C'.
Vertakkingen in de boom worden aangegeven met de haken: '(' en ')'. De lading van een atoom wordt weergegeven door een aantal keren '-' of '+' achter het label te plaatsen of door een keer '-' of '+' en dan een numerieke waarde. Zo kan het hydroxide [[anion]] gerepresenteerd worden door <nowiki>'[OH-]'</nowiki> en door <nowiki>'[OH-1]'</nowiki>.
| |||