Op 20 maart 1920 werd voetbalvereniging De Kooi opgericht. Deze club fuseerde in 1965 met voetbalvereniging RKVV Friso (26 mei 1930) tot SC Joure. De oprichtingsdatum van de oudste club werd daarbij als oprichtingsdatum gehandhaafd. Op 24 mei 1971 werd korfbalverenigingDe Jouwer opgenomen in de voetbalverenigingSC Joure. De thuiswedstrijden worden op het sportpark "de Hege Simmerdyk" gespeeld.
Het standaardelftal speelt sinds het seizoen 2016/17 in de Tweede klasse van het KNVB-district Noord. Vanaf het seizoen 2020/21 is dit het enige standaardelftal van de club.
In 2002 en 2003 promoveerde dit team tweemaal achter elkaar van de Tweede klasse naar de Hoofdklasse, door tweemaal kampioen te worden. Eerst van de tweede klasse L in 2002 en vervolgens in 2003 van de Eerste klasse F. In 2005 behaalde de club de grootste prestatie uit de clubgeschiedenis door derde te eindigen in de Hoofdklasse. In 2007 degradeerde de club naar de eerste klasse, maar keerde na een jaar terug in de Hoofdklasse C. In het seizoen 2009/10 degradeerde de club opnieuw.
In het seizoen 2015/16 kwam dit team nog uit in de Eerste klasse na de degradatie in het seizoen 2013/14. Voor het seizoen 2016/17 werd het team niet ingeschreven.[1] In het seizoen 2017/18 werd het team weer aangemeld welke op het laagste amateurniveau diende in te stromen, dit was de Vijfde klasse. In 2018/19 werd middels het klassekampioenschap de Vierde klasse bereikt. Voor het seizoen 2020/21 werd geen zondagteam meer ingeschreven.[2]
SC Joure plaatste zich tot nu toe driemaal voor de KNVB beker.
In 2002 plaatste het zich via de Noordelijke districtsbeker, die dat jaar werd gewonnen, en werd er in de Amstel Cup van SC Genemuiden (6-2) en verrassend van Cambuur (6-4) in de groepsfase en van Vitesse-2 (2-1) in de 2e ronde gewonnen en werd in de 3e ronde bijna eredivisionist FC Groningen (2-3) verslagen.
In 2005 plaatste SC Joure zich voor de KNVB beker door derde te worden in de competitie, maar verloor het na een goede wedstrijd van Ajax-2 (0-2).
In 2009 speelde SC Joure weer in het KNVB bekertoernooi. In de eerste ronde werd met 2-0 gewonnen bij Drachtster Boys, waardoor de club op 23 september 2009 aantrad tegen eredivisionist FC Twente. Dit duel werd met 0-8 verloren.
