Polymerase

Een polymerase is een enzym (EC 2.7.7.6/7/19/48/49) dat lange ketens of polymeren van aminozuren of nucleotiden synthetiseert. DNA-polymerase en RNA-polymerase worden gebruikt bij het samenstellen van DNA- en RNA-moleculen, respectievelijk door bij het kopiëren van een DNA- of RNA-templatestreng gebruik te maken van basenparing interacties.

Structuur van Taq-DNA-polymerase

Er zijn ook polymerasen, die geen template nodig hebben, zoals het poly-A-polymerase (PAP), dat de poly-A-staart aan een mRNA-molecuul vastmaakt. Terminale-deoxynucleotidyl-transferase (TdT) is een DNA-polymerase, die ook geen template nodig heeft.

Een polymerase van de thermofiele bacterie, Thermus aquaticus (Taq) (PDB 1BGX, EC 2.7.7.7) wordt gebruikt bij de polymerasekettingreactie (PCR).

Type	Afkorting	Uitgangsmolecuul → product	Functie
DNA-afhankelijke DNA-polymerase	DDDP	DNA → DNA	Replicatie
RNA-afhankelijke DNA-polymerase	RDDP	RNA → DNA	Reverse-transcriptie
DNA-afhankelijke RNA-polymerase	DDRP	DNA → RNA	Transcriptie
RNA-afhankelijke RNA-polymerase	RDRP	RNA → RNA	Replicatie van vele RNA-virussen
onafhankelijke RNA-polymerase		→ RNA
onafhankelijke DNA-polymerase		→ DNA

Bekende polymerasen

• DNA-polymerase voor de deling van DNA
  • DNA-polymerase I
  • DNA-polymerase II
  • DNA-polymerase III holo-enzyme
  • DNA-polymerase IV (DinB) – SOS-repair-polymerase
  • DNA-polymerase V (UmuD'2C) - SOS-repair-polymerase
• RNA-polymerase voor de transcriptie van DNA naar RNA
  • RNA-polymerase I
  • RNA-polymerase II
  • RNA-polymerase III
  • T7 RNA-polymerase
• Terminale-deoxynucleotidyl-transferase (TDT)
• Reverse-transcriptase

Bronnen, noten en/of referenties